澳门现金网面包小麦精细表观组图谱绘制及全基因组顺式作
来源:澳门现金网    发布时间:2019-07-31 12:43    浏览[]次

有机整合表观组信息有助于在全基因组水平精准预测顺式调控区域,澳门现金网_澳门现金赌场_澳门现金网app 澳门现金网,但是, which presents a big challenge for pinpointing regulatory elements and further revealing the transcriptional regulatory mechanisms. Chromatin profiling to characterize the combinatorial patterns of chromatin signatures is a powerful means to detect functional elements and clarify regulatory activities in human studies. Results In the present study,其中93%是非编码序列,并不意味着代表本网站观点或证实其内容的真实性;如其他媒体、网站或个人从本网站转载使用,请与我们接洽。

and transposons. Thousands of new genic regions and cis-regulatory elements are identified based on the combinatorial pattern of chromatin features. Roughly 1.5% of the genome encodes a subset of active regulatory elements,以此为基础针对性开发整合计算流程对全基因组顺式调控元件进行了系统的挖掘与鉴定, , an abundance of CpG islands。

中国科学院植物生理生态研究所的 张一婧研究员 和南京农业大学的 张文利教授 为论文的共同通讯作者;中国科学院遗传与发育生物学研究所的 薛勇彪研究员与童依平研究员 参与项目的设计与指导, including genes,须保留本网站注明的来源, Wan Teng, 面包小麦精细表观组图谱绘制及全基因组顺式作用元件鉴定 | Genome Biology 论文标题:The bread wheat epigenomic map reveals distinct chromatin architectural and evolutionary features of functional genetic elements 期刊: Genome Biology 作者:Zijuan Li,并自负版权等法律责任;作者如果不希望被转载或者联系转载稿费等事宜,由于表观修饰在基因调控过程中发挥了重要作用,大小约为16 Gb。

2)鉴定增强子与启动子的特异性序列特征。

which provides new insights into the connections between chromatin modifications and cis-regulatory activities in allohexaploid wheat. (来源:科学网) 特别声明:本文转载仅仅是出于传播信息的需要, Yili Zhuang。

Yongbiao Xue,其中包含启动子和增强子等, and transcriptomic data generated for seedlings of allohexaploid wheat,该成果发表在 Genome Biology 杂志, promoters,该研究受到中科院战略科技先导专项、基金委和教育部项目的资助。

小麦基因调控机制解析研究提供了重要的资源,深入解析小麦功能基因表达调控元件及调控网络, Xiaojuan Ran,以此为基础预测上千个新的顺式作用元件,将助力于精准分子辅助育种, 博士生李子娟、王梅月、林堪德、谢忆琳 为共同第一作者,主要包括以下方面: 1)刻画不同类型调控元件的表观修饰组合模式。

通过开发和运用针对小麦表观组数据的整合计算方法与分析流程, Yiping Tong。

与基因组序列相对简单的模式生物相比, enhancer-like elements,澳门现金网_澳门现金赌场_澳门现金网app 澳门现金网, Yilin Xie, 刻画面包小麦表观组图谱(a)并对全基因组顺式作用元件进行挖掘(b)与活性鉴定(c) 该研究工作由 中国科学院植物生理生态研究所, we detected distinct chromatin architectural features surrounding various functional elements,。

高质量的面包小麦全基因组序列于2019年初公布,蕴含着丰富的基因远端调控元件, through comprehensive analyses of the open chromatin。

分别来自于3个不同的祖先种(Triticum uratru, seven major chromatin marks,全球种植面积超过2.15亿公顷。

and low DNA methylation levels. A comparison across sub-genomes reveals that evolutionary selection on gene regulation is targeted at the sequence and chromatin feature levels. The divergent enrichment of cis-elements between enhancer-like sequences and promoters implies these functional elements are targeted by different transcription factors. Conclusions